برخی منابع به دلیل حمایتهای گسترده آقای هاشمی رفسنجانی از این مدارس و فعالیتهای عملی آنها در دوره ریاستجمهوری ایشان، شروع مدارس غیرانتفاعی را به دولت ایشان نسبت میدهند. با این حال، تصویب قانون، در دوره رئیسجمهور وقت یعنی آیتالله خامنهای انجام شده است.