روزنامه بریتانیایی «تایمز» در گزارشی فاش کرد سازمان اطلاعات اسرائیل (موساد) و آژانس اطلاعات مرکزی آمریکا (سیا) در حال پیشبرد یک عملیات مشترک برای ردیابی مجتبی خامنهای هستند. با این حال، به دلیل غیبت طولانیمدت او، فرضیههای اطلاعاتی مختلفی پیرامون احتمال کشتهشدن یا جراحت شدید او مطرح شده است.بر اساس این گزارش، مجتبی خامنهای از زمان کشتهشدن پدرش در حمله هوایی 28 فوریه اسرائیل و متعاقب آن در دست گرفتن قدرت، کاملاً از انظار عمومی پنهان شده است. با وجود توانمندیهای گسترده اطلاعاتی واشینگتن و تلآویو، تعیین مکان دقیق اختفای او با چالشهای فزایندهای روبهروست.تایمز مینویسد، خامنهای حدود 150 روز است که از هیچگونه تلفن همراه یا رایانهای استفاده نکرده است.گمانهزنیها حاکی از آن است که او در یک پناهگاه عمیق زیرزمینی مستقر بوده و چهرهاش بر اثر جراحات وارده در همان حملهای که به کشتهشدن پدرش انجامید، به شدت آسیب دیده و تغییر شکل داده است.